Cuộc xung đột Trịnh - Nguyễn kéo dài hơn một thế kỷ, gây ra hậu quả nặng nề cho đất nước. Một trong những lý do chính phản đối cuộc xung đột này là sự tàn phá và hủy hoại mà nó mang lại. Chiến tranh kéo dài đã gây tổn thất về người và tài sản, làm suy yếu đất nước và dân tộc Việt Nam. Thị trấn bị phá hủy, nông trại bị thiêu đốt, dân chúng chịu nhiều khổ đau. Sự chia rẽ và xung đột không chỉ làm suy yếu quốc gia mà còn tạo ra những kẽ hở, làm mất lòng tin và đồng lòng của dân tộc trong việc đoàn kết và phát triển. Cuộc xung đột này đã làm mất đi những cơ hội cho sự phát triển bền vững và ổn định của đất nước, khiến cho nền văn minh và kinh tế bị đình trệ, tạo ra những hậu quả kéo dài lâu dài cho quá trình phát triển sau này.