Một số biện pháp giảm thiểu sự ô nhiễm môi trường do sử dụng phân bón không đúng cách như :

- Sử dụng phân bón hữu cơ thay vì phân bón hóa học chứa nhiều hóa chất độc hại

- Xác định được lượng phân cần sử dụng theo đúng nhu cầu cây trồng, tránh lãng phí phân bón

- Chế biến phân hữu cơ để giảm thiểu mùi tanh và các chất khí gây ô nhiễm

- Giáo dục và hướng dẫn mọi người cách bón phân hiệu quả, tuyên truyền.