Xét tỉ lệ 3:1

Tỷ lệ này có thể là do các đặc điểm cây cao/thấp hoặc tròn/dài.
Xem xét đặc điểm cây cao/thấp: P có thể là Aa x Aa.
Aa x Aa → F1: 1 AA (cây cao): 2 Aa (cây cao): 1 aa (Cây thấp). Tỷ lệ của 3 cây cao: 1 cây thấp.

Xét tỉ lệ 1:2:1

Tỷ lệ nàỳ phải do tính trạng còn lại ( quả tròn / dài )

P có thể là Bb x Bb 
Bb x Bb → F1: 1 BB (Quả tròn): 2 Bb (quả tròn): 1 bb (quả dài). Tỷ lệ 3 quả dài.

liên kết hoàn toàn

Điều này có nghĩa là hai cặp gen A/a và B/b nằm trên cùng một nhiễm sắc thể và di truyền cùng nhau.
Nếu P dị hợp 2 cặp gen (AaBb) và các gen liên kết hoàn toàn thì ta phải xem xét kiểu gen và sự phân ly của các alen.

F1 phân li

P : AaBb x AaBb

Kiểu gen liên kết hoàn toàn : AB và ab

Phân li :

AB x AB → AB ( cây cao , quả tròn )

AB x ab →AaBb ( cây cao , quả tròn )

ab x AB → AaBb ( cây cao , quả tròn )

ab x ab → ab ( cây thấp , quả dài )

Từ đó cho ta thấy 3 ( cây cao , quả tròn ): 1( cây thấp , quả dài )

 Vậy P cần một kiểu gen AaBb liên kết hoàn toàn mới thỏa mãn F1 phân li theo tỷ lệ 3: 1 và 1: 2: 1