Ở F2 trong phép lai, 2 cặp tính trạng của Menđen xuất hiện 2 biến dị tổ hợp có kiểu hình hình thành từ sự tổ hợp lại các tính trạng của bố và mẹ, khác với kiểu hình của bố và mẹ.

Ví dụ, ở phép lai hai cặp tính trạng về màu sắc hoa và hình dạng hạt của đậu Hà Lan, nếu bố mẹ có kiểu hình thuần chủng đỏ, trơn và vàng, nhăn thì F1 đều có kiểu hình đỏ, trơn. Ở F2, có 4 kiểu hình, trong đó 2 kiểu hình biến dị tổ hợp là đỏ, nhăn và vàng, trơn.

Như vậy, hai biến dị tổ hợp ở F2 có kiểu hình khác với kiểu hình của bố và mẹ, hình thành từ sự tổ hợp lại các tính trạng của bố và mẹ.

VD:

+ Kiểu hình trội lặn (ví dụ: đỏ, nhăn): Đây là kiểu hình có một tính trạng trội và một tính trạng lặn. Tính trạng trội là tính trạng biểu hiện ở F1, còn tính trạng lặn là tính trạng biểu hiện ở F2.

+Kiểu hình lặn lặn (ví dụ: vàng, trơn): Đây là kiểu hình có cả hai tính trạng đều là lặn.