Hợp chất là 1 chất được cấu tạo bởi từ 2 nguyên tố khác loại trở lên, có trật tự và thành phần cố định
Phân tử là 1 nhóm trung hòa về điện, có 2 hoặc nhiều hơn nguyên tử liên kết với nhau
=> hợp chất tạo bởi 2(hoặc hơn) nguyên tố khác loại, phân tử tạo bởi 2 (hoặc hơn) nguyên  tử cùng loại

Hợp chất là 1 chất được tạo thành bởi 2 nguyên tố khác nhau. Hợp chất được cấu tạo bởi nguyên tử của các nguyên tố khác nhau

Các phân tử là 2 hoặc nhiều nguyên tử liên kết với nhau. 
Để phân biệt thì khi từ 2 chất trở lên thì ta thường gọi hợp chất chứ không còn gọi phân tử.

Tuy nhiên vẫn có thể gọi là phân tử $NH_3$, phân tử $H_2O$,... 

Phân tử chính là phần nhỏ nhất của hợp chất.
Nói chung là nó tương đương nhau nhưng vẫn có những điểm khác nhau á như là cách gọi tên,...
Thường thì chỉ gọi phân tử $N_2$, $H_2$,... cho đơn chất thôi

còn hợp chất thì ng ta gọi hợp chất luôn.