Thành phần các kiểu thảm thực vật được phân thành 6 kiểu: 1) Kiểu rừng kín thường xanh, mưa nhiệt đới (<700 m). 2) Kiểu rừng kín lá cứng hơi ẩm nhiệt đới (<700 m). 3) Kiểu rừng trên núi đá vôi (<700 m). 4) Kiểu trảng cây to, cây bụi, cỏ cao khô nhiệt đới (<700 m). 5 Kiểu rừng kín lá rộng thường xanh, mưa mùa á nhiệt đới núi thấp (700-1.600 m). 6) Kiểu rừng kín hỗn giao cây lá rộng, và lá kim, ẩm, á nhiệt đới núi thấp (700-1.600 m).
Trên cơ sở đó, nhóm nghiên cứu đã đề xuất các giảo pháp bảo tồn. Tập trung thực hiện 4 nhóm giải pháp:
 Nhóm giải pháp tuyên truyền, nâng cao nhận thức cộng đồng trong bảo vệ môi trường và đa dạng sinh học.
Nhóm các giải pháp về bảo tồn tài nguyên đa dạng sinh học, gồm: Bảo tồn tại chỗ: Đánh giá được thực trạng các loài quý, hiếm, đặc hữu, loài mới cho khoa học, các loài có giá trị kinh tế cao để có hướng vừa bảo tồn vừa khai thác bền vững như: Trà hoa vàng Nghệ An (Camellia ngheanensis), Trà hoa vàng pù khạng (Camellia pukhangensis), Bo bo (Alpinia spp.), Lan kim tuyến, Khôi tía, Huyết rồng, Kim cang, Bách xanh, lan hài, Pơ mu, Sa mu dầu... Và bảo tồn chuyển chỗ: Thử nghiệm nhân giống và trồng bảo tồn một số loài thực vật nguy cấp, có gía trị (hạt trần, một số loài cây thuốc) trong phân khu dịch vụ hành chính, nơi có điều kiện phù hợp với nơi sống của loài hoặc trong khu vực dự kiến xây dựng vườn thực vật, nhằm bảo tồn nguồn gen thực vật.
Nhóm giải pháp tổ chức hoạt động kinh tế, khoa học và công nghệ nhằm sử dụng hợp lý tài nguyên đa dạng sinh học Xây dựng và nhân rộng các mô hình, các vườn ươm giống đạt chuẩn về các loài cây bản địa, cây dược liệu có giá trị cao đặc sản của địa phương như: Lựa chọn một số đối tượng, mô hình đã thành công để nhân rộng, phát triển thành hàng hóa như Trà hoa vàng (hiện nay đã được phát triển thành thương hiệu hàng hóa rất tốt ở huyện Quế Phong).  Ưu tiên thực hiện các nghiên cứu chuyên sâu về phân bố, đặc tính sinh học, sinh thái học các loài thực vật nguy cấp, có giá trị như hoặc có số lượng rất ít phân bố rất hẹp tại KBTTN như: Sa mộc dầu, Đỉnh tùng, Lan hài xanh, Hồi nước, Kê huyết đằng,… nhằm xây dựng các giải pháp khả thi bảo tồn và phát triển bền vững các loài này. Nhóm giải pháp cơ chế, chính sách Xây dựng, bổ sung các cơ chế chính sách về quản lý, bảo vệ, phát triển rừng theo quy định của Luật Lâm nghiệp, để người dân được thụ hưởng chính sách, tạo sinh kế và việc làm, giảm áp lực tác động tiêu cực đến rừng tự nhiên, đặc biệt là chính sách chi trả dịch vụ môi trường rừng; chính sách khoán bảo vệ rừng; chính sách vay vốn trồng rừng, chăn nuôi xóa đói giảm nghèo theo Nghị định 75/2015/NĐ-CP của Chính phủ.