Linux có điểm yếu:

-Chỉ phù hợp cho các đối tượng nhất định: lập trình viên,hacker,các chuyên gia bảo mật

-Chủ yếu sử dụng các dòng lệnh

-khố tiếp cận và học cách dùng

-bị giới hạn các ứng dụng,chương trình

-1 số drive không có hỗ trợ 

-1 số phần mềm không thể tải về được 

Bởi Linux có những nhược điểm :

• Kho ứng dụng ít: Mặc dù có các phiên bản giả lập và phần mềm hỗ trợ chạy trên Linux nhưng vì đây là hệ điều hành dành cho lập trình viên, điều này sẽ gây khó khăn cho một số người dùng mới vì bạn phải tìm những bài viết hướng dẫn mỗi khi muốn chạy một ứng dụng nào đó.
• Hỗ trợ Drivers còn hạn chế: Một số nhà sản xuất không phát triển drivers hỗ trợ chạy trên nền tảng Linux, do đó, bạn sẽ gặp nhiều khó khăn trong việc sử dụng các ứng dụng, phần mềm.
• Khó làm quen: Nếu bạn đã quen thuộc với Windows thì sẽ mất một thời gian để quen thuộc với giao diện và cách sử dụng hệ điều hành Linux.